六朝博物馆为南京市博物总馆分支机构，位于南京市玄武区长江路302号，馆址系原六朝建康城遗址的一部分。建筑面积为2.3万多平方米，由美国贝氏建筑事务所设计，体系化地将贝氏建筑模数、贝式建筑几何、贝氏建筑光影运用于此。

六朝博物馆是南京最大的展示六朝文物、展示六朝历史文化的专题断代史博物馆。

六朝博物馆展陈的核心主题是展示东方大都会的风采，常设六朝帝都、六朝风采和六朝人杰三个展览，2015年被评为第十二届全国十大陈列精品。